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瞿介明教授揭示PANoptosis(泛凋亡)预测COVID-19病情严重程度与预后

2024-09-29作者:论坛报小璐资讯
非原创

2024年4月,瞿介明教授在生物信息学领域期刊《Briefings in Bioinformatics》(IF 6.8,Q1杂志发表题名为“PANoptosis, an indicator of COVID-19 severity and outcomes.”——PANoptosis(泛凋亡)预测COVID-19病情严重程度与预后的研究论文。


瑞金医院呼吸与危重症医学科瞿介明教授、李亚男助理研究员为论文的共同通讯作者;杨清源博士研究生、宋晚妹博士研究生、哈尼再尔·热合曼硕士研究生为论文的共同第一作者。


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 doi: 10.1093/bib/bbae124.


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未能及时产生有效的免疫反应以及未能控制的过度免疫反应是COVID-19的主要致死原因。TNF-α和IFN-γ介导的PANoptosis(泛凋亡)在COVID-19中持续加剧细胞因子风暴和多器官损伤。PANoptosis是一种独特的炎症性程序性细胞死亡过程,具有细胞焦亡(pyroptosis)、凋亡(apoptosis)和()坏死性凋亡(necroptosis)的关键特征。PANoptosis的适度激活可触发免疫细胞的浸润,从而清除病原体。尽管PANoptosis在宿主防御中发挥不可或缺的作用,但需要更多研究来明确PANoptosis如何调节COVID-19的免疫反应和预后。


该研究利用单细胞转录组测序(scRNA-seq)和普通转录组测序(bulk RNA-seq)数据集,系统分析了在COVID-19中PANoptosis的转录组和细胞景观。研究者的研究结果显示,支气管肺泡灌洗液(BALF)和外周血单个核细胞(PBMC)中PANoptosis的发生程度能够反映COVID-19的严重程度。通过scRNA-seq分析,研究者确定了促炎单核细胞是COVID-19中PANoptosis的主要发生场所。随后的研究揭示了这些促炎单核细胞的免疫和代谢特征。值得注意的是,促炎单核细胞表现出与细胞趋化、细胞迁移、信号传导和免疫防御相关通路的高度激活。在COVID-19中,促炎单核细胞的代谢特征发生了显著变化,影响了包括碳水化合物、脂类和氨基酸代谢在内的多种代谢途径。此外,研究者的分析表明地塞米松可能通过减轻PANoptosis来缓解COVID-19中的过度炎症反应。最后,研究者的研究发现PANoptosis的相关基因能够准确预测住院COVID-19患者的疾病进展和预后,为COVID-19的转归判断提供了新的视角。


作者介绍


瞿介明 主任医师,教授,博士生导师,上海交通大学医学院附属瑞金医院党委书记,上海交通大学医学院呼吸病研究所所长,上海市呼吸传染病应急防控与诊治重点实验室主任,中华医学会呼吸病学会主任委员;研究方向:肺部感染及新型治疗策略与技术。


李亚男 助理研究员,上海交通大学医学院附属瑞金医院呼吸与危重症医学科;上海市呼吸传染病应急防控与诊治重点实验室秘书;研究方向:肺部感染与免疫。


杨清源 博士研究生,上海交通大学医学院附属瑞金医院呼吸与危重症医学科;研究方向:肺部感染。


宋晚妹 博士研究生,上海交通大学医学院附属瑞金医院呼吸与危重症医学科;研究方向:肺部感染。


哈尼再尔·热合曼 硕士研究生,上海交通大学医学院附属瑞金医院呼吸与危重症医学科;研究方向:肺部感染。


本文转自:瑞金医院图书馆

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