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预测结直肠癌患者预后和临床特征的铁死亡相关基因预后模型 | 研究速递

2021-07-23作者:论坛报小塔资讯
其他消化疾病非原创

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结直肠癌(CRC)是全球最常见的恶性肿瘤之一。铁死亡是一种新定义的细胞死亡形式,具有不同的形态、生物学和遗传学特征,并参与 CRC的进展和治疗。瑞金医院孙晶副主任医师牵头开展一项研究,旨在建立预测模型,阐明铁死亡与CRC患者预后的关系,探索铁死亡在CRC治疗中的潜在价值。研究论文2021年6月24日在线发表于《FRONTIERS IN ONCOLOGY》杂志。


该研究铁死亡相关基因来自GeneCards和FerDb网站。该研究还分析了独立预后因素、下游功能富集、药物敏感性、体细胞突变状态和免疫相关特征。同时所有的结论都通过使用国际癌症基因组联盟 (ICGC) 和基因表达数据库(GEO) 中的多个数据集进行了验证。


研究者通过Lasso Cox分析方法建立了铁死亡相关基因(TFAP2C、SLC39A8、NOS2、HAMP、GDF15、FDFT1、CDKN2A、ALOX12、AKR1C1、ATP6V1G2)预后模型,通过ROC和 Kaplan-Meier(K-M)分析来预测该模型对CRC患者预后的预测能力。高危组和低危组的CRC患者中存在明显的免疫细胞浸润差异,包括巨噬细胞和CD8+ T细胞等。此外,药物敏感性和体细胞突变状态(如 TP53)也与风险评分密切相关。


在本研究中,研究人员建立了一种新的铁死亡相关的10基因预后模型,它可以有效预测CRC患者的预后和OS,并为靶向治疗或免疫治疗提供参考价值。靶向铁死亡可能是CRC患者的一个很好的治疗选择。


文章首发自瑞金医院图书馆

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