致泻性大肠埃希菌分型中，肠产毒性大肠埃希菌（ETEC）、肠致病性大肠埃希菌（EPEC）和肠侵袭性大肠埃希菌（EIEC）肠炎表现为黏液脓便时，抗菌药物推荐选用第三代头孢霉素［头孢噻肟50~100 mg/（kg·d），每12小时或每6小时静脉滴注1次；头孢唑肟40~150 mg/（kg·d），每12小时或每8小时静脉滴注1次；头孢曲松20~80 mg/（kg·d），每日或每12小时静脉滴注1次；头孢他啶30~100 mg/（kg·d），每12小时或每8小时静脉滴注1次；头孢克肟3~6 mg/（kg·d），重症可加至12 mg/（kg·d），每12小时口服1次；头孢哌酮50~200 mg/（kg·d），每12小时或每8小时静脉滴注1次］；也可选用磷霉素50~100 mg/（kg·d），每8小时或每6小时口服1次或100~300 mg/（kg·d），每12小时或每6小时静脉滴注1次］。肠出血性大肠埃希菌（EHEC）肠炎多为自限性疾病，不推荐使用抗菌药物，并且使用抗菌药物并不能够缩短病程，反而可能使病原菌溶解释放大量类志贺毒素，从而诱发溶血尿毒综合征。但对于高热和中毒症状严重者，则可适当应用抗菌药物。

弯曲菌肠炎多为自限性疾病，且预后良好，故一般不推荐抗菌药物治疗。但对病情重、病情迁延（高热、血性便、病程延长1周以上）的患儿，推荐使用抗菌药物阿奇霉素10 mg/（kg·d），每日1次，每周3天为1个疗程；或首日10 mg/（kg·d），第2~5天剂量减半，共使用5 d；一般1个疗程即可，严重者需要治疗2~3个疗程；红霉素40~50 mg/（kg·d），每8小时或每6小时口服1次，总疗程5~7 d，重症感染者疗程延至3~4周，病情重者应早期使用。

已报道的沙门菌血清型超过2500种，超过20种可导致人畜共患病。“儿童急性感染性腹泻病诊疗规范（2020版）”建议鼠伤寒沙门菌首选第三代头孢菌素，如头孢噻肟、头孢曲松、头孢他啶、头孢哌酮（使用剂量及频次同致泻性大肠埃希菌治疗方案）。也可选用哌拉西林他唑巴坦［60~150 mg/（kg·d），每8小时或每6小时静脉滴注1次］，阿奇霉素和喹诺酮类抗菌药物也可作为备选。澳大利亚传染病学会还对非伤寒沙门菌疗程进行了归纳总结，推荐肠道内感染的疗程为7 d，菌血症为7~10 d，脑膜炎或骨髓炎则为4~6周。

《国家抗微生物治疗指南》推荐志贺菌感染的首选抗菌药物是氟喹诺酮类药物和复方新诺明。但喹诺酮类药物［左氧氟沙星10~15 mg/（kg·d），5~7 d为1个疗程］在儿童中使用有严格限制，复方新诺明［25~50 mg/（kg·d），每12小时口服1次，7 d为1个疗程］禁用于2月龄以下婴儿和葡萄糖-6-磷酸脱氢酶缺乏患儿，故推荐第三代头孢菌素作为临床治疗志贺菌属的首选用药［头孢曲松50 mg/（kg·d），每日1次静脉滴注；头孢噻肟50 mg/（kg·次），每8小时1次静脉滴注；头孢克肟使用剂量及频次同致泻性大肠埃希菌治疗方案］。氨苄西林、氨苄西林舒巴坦对于志贺菌耐药率较高，故不推荐使用。

是抗菌药物相关性肠炎和伪膜性肠炎的主要致病菌，对于轻中型艰难梭菌相关性腹泻患儿，最有效的治疗方法是停用原抗菌药物。对有严重腹泻者或停用原抗菌药物后仍然不能改善者，可选用甲硝唑［30 mg/（kg·d），每8小时口服1次］或万古霉素［10~40 mg/（kg·d），每6小时口服1次］。替考拉宁、替加环素及非达霉素也可用于治疗艰难梭菌感染。

我国儿童诊断急性感染性胃肠炎的病例中，病原学检出率仅35%左右，对于这类患儿治疗的原则主要是维持内环境平衡，必要时使用抗菌药物。抗感染的经验性用药需结合患儿自身条件、粪便性状、流行病学等情况。对于一般情况良好的水样便患儿，粪常规检查未见或可见少量白细胞，病原多为病毒或产毒素性细菌感染，感染过程具有自限性，在排除霍乱后不推荐使用抗菌药物。对于粪便呈黏液脓性或脓血便的痢疾样腹泻（粪检可见多形核白细胞）患儿、伴明显中毒症状且肠外症状明显者，尤其是重症患儿、早产儿、<3月龄小婴儿和免疫功能低下者，推荐抗菌药物治疗，常见病原有致泻性大肠埃希菌、非伤寒沙门菌和近年来感染率显著上升的肺炎克雷伯菌，推荐使用第三代头孢菌素。当患儿治疗效果不佳考虑耐药菌感染时，可次选β内酰胺类-β内酰胺酶抑制剂复方制剂，出现重症感染时，可选亚胺培南。

细菌性胃肠炎是一种全球性疾病，对公共卫生的发展有重大意义。抗生素的不合理使用会不断加速各种细菌的耐药性，导致治疗效果差。因此，临床医师在治疗过程中应结合患儿自身病情、粪便性状、本地区人群的病原学、病原检测及药物敏感性检测等做出合理决策。