壹生资讯-全基因组测序揭示中国支原体肺炎流行现状

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全基因组测序揭示中国支原体肺炎流行现状 | 呼吸临床研究展播

2025-03-21作者：论坛报小璐资讯

非原创

成果名称：全基因组测序揭示中国肺炎支原体分子流行病学及耐药突变特征

Whole-genome sequencing unveils the outbreak of Mycoplasma pneumoniae in mainland China

发表期刊：《柳叶刀•微生物》（Lancet Mocrobe，IF 20.9）

通讯作者：俞云松教授周华教授

主要作者单位：浙江大学医学院附属第一医院

研究解读

2023年10中旬以来，中国北部地区（例如北京市和辽宁省）的呼吸道疾病显著增加，流感样疾病病例明显多于过去三年，这种趋势可能与呼吸道合胞病毒、流感病毒以及肺炎支原体等病原体的传播有关。然而，目前仍然缺乏有关中国肺炎支原体的流行病学和耐药率的数据，这可能与肺炎支原体本身难以培养有关。这种诊断挑战的存在使得基于新一代测序技术的分子诊断方法成为被期待的手段。本研究的目的是通过全基因组捕获测序揭示中国内地肺炎支原体的流行及耐药特点。

这是一项多中心的回顾性研究。研究收集了浙江大学医学院第一附属医院、浙江省人民医院等医院的成人或儿童的肺炎支原体阳性的肺泡灌洗液样本，这些样本来自中国七个地区（包括西南、西北、中部、南部、东部、北部和东北），并进一步对样本进行了基于肺炎支原体全基因组捕获测序的分子流行病学分析，包括多位点序列分型（MLST）分析、核心基因组多位点序列分型（cgMLST）、系统发育分析及耐药突变分析。

从2021年6月到2023年12月期间，在中国七个地区的106名儿童和130名成人中收集了236个肺炎支原体阳性肺泡灌洗液样本。有91个样本适合进行MLST。MLST分析提示，序列类型（ST）3（n=63，69.23%）和ST14（n=21，23.07%）是主要的肺炎支原体流行株（图1）；其次是ST7型（n=7，7.69%）。将cgMLST和MLST分析相结合，236个样本中的 149个样本可以进行分型，其中ST3型（n=104，69.79%）和 ST14型（n=29，19.46%）是最常见的；其次是ST7型（n=13，8.72%）。在236例肺炎支原体阳性样本中，168个样本产生了足够的测序数据能够满足耐药突变分析。研究显示，ST3型和ST14型的菌株多存在A2063G突变，而ST7型菌株未发现此突变；23S核糖体核糖核酸（rRNA）中大环内酯类抗生素耐药相关基因突变率为88.10%（n=148），均为 A2063G突变（图2）。系统发育树（图3）揭示了中国主要流行的肺炎支原体克隆与全球流行克隆之间的进化关系。结果表明，全球流行的ST3型（P11型）和ST14型（P12型）肺炎支原体自2022年以来也一直在中国流行。