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成果名称:基于机器学习的模型开发用于预测伴有肝脏脂肪变性慢乙肝患者的肝脏炎症:一项队列研究
Development of a machine learning-based model to predict hepatic inflammation in chronic hepatitis B patients with concurrent hepatic steatosis: a cohort study
发表期刊:《电子临床医学》(eClinicalMedicine)(Q1区,IF:15.1)
通讯作者:李婕、施军平、谢青
第一作者:芮法娟、杨毅辉、徐亮
主要作者单位:南京大学医学院附属鼓楼医院
面临慢性乙型肝炎(CHB)合并脂肪肝(HS)无创诊断难题,本研究通过多中心肝穿刺队列,运用机器学习算法构建肝脏炎症诊断模型。该模型在训练、验证队列均展现出稳定性和准确性,为CHB合并HS患者提供精准无创诊断工具。
慢性乙型肝炎和肝脂肪变性共存的问题日益普遍。CHB和HS均为慢性肝损伤的主要原因,增加患者罹患肝硬化和肝细胞癌的风险。慢性肝脏炎症是导致肝纤维化、肝硬化、肝癌发生的关键驱动力。因此,早期、准确识别CHB合并HS患者肝脏炎症的严重程度对改善患者的预后至关重要。
基于此,我们进行了这一项回顾性、多中心的队列研究,纳入2004年4月至2022年9月期间来自中国11家医疗中心1787例未经抗病毒治疗的CHB合并HS患者。689例患者作为训练队列(肝活检队列),509例患者肝活检验证队列1和589例患者超声验证队列2分别作为两个独立的外部验证队列。该研究应用shapley additive explanations方法评估23个特征在诊断中重度炎症(Scheuer’s system ≥ G3)的重要性。分别使用7种机器学习方法GBC、RF、XGB、ADB、GNB、LR和KNN构建模型,最终来自训练队列的11个变量(AST、PT、PLT、ALB、GGT、HBeAg阳性、HBsAg、WBC、INR、BMI和Tbil)被纳入GBC模型用于识别中重度炎症。在训练队列中,GBC的AUC范围为0.62~0.86。在验证队列1(肝活检队列)和2(超声队列)中,AUC的范围分别为0.61-0.89和0.72~0.78(图2)。为深入探讨GBC模型在特定患者群体中的诊断性能,研究进一步评估GBC模型在不同年龄、性别、BMI、HBeAg状态、HBV DNA水平和是否患有糖尿病患者亚组中诊断中重度肝脏炎症的表现。在训练队列和两个外部验证队列中,GBC模型在HBV DNA ≥105 IU/mL的患者中具有最高的AUC,分别为0.87(95% CI 0.84~0.91)、0.90(95% CI 0.86~0.94)和0.79(95% CI 0.74~0.83)。
该研究通过多种机器学习方法构建CHB和并HS患者的无创炎症诊断模型,最终选择GBC构建模型,同时评估GBC模型在外部肝活检和超声诊断的HS验证队列及不同亚组中的性能,证明GBC模型的可推广性和稳定性。为方便临床医生使用该模型,该团队建立一个免费网站https://py3.reallife-liver.com/。该研究建立的GBC模型有可能成为一种有价值的无创诊断工具,用于精准识别并发HS的CHB的肝脏炎症。
慢性乙型肝炎(CHB)与肝脂肪变性(HS)共存情况对患者健康存在双重威胁。这两种病症不仅是慢性肝损伤的关键驱动因素,而且大幅提升了患者发展肝硬化和肝细胞癌的概率。此外,慢性肝脏炎症也是肝纤维化、肝硬化乃至肝癌发生的关键驱动力。在这一背景下,早期精确地评估CHB合并HS患者肝脏炎症的程度成为改善患者预后的关键。
我们团队发表于《电子临床医学》(eClinicalMedicine)的一项回顾性、多中心队列研究,通过纳入2004年4月至2022年9月期间来自中国11家医疗中心的1787例未经抗病毒治疗的CHB合并HS患者,展示了利用机器学习方法建立无创炎症诊断模型。该研究的方法论及其发现,为临床提供了新的视角和工具,用以更精准地识别和管理这一复杂的患者群体。
研究通过分析689例患者的肝活检数据(训练队列)和两个独立外部验证队列(共1098例患者),评估了23个特征在诊断中重度肝脏炎症(根据Scheuer’s system ≥ G3)中的重要性,并利用七种不同的机器学习方法(GBC、RF、XGB、ADB、GNB、LR和KNN)来构建模型。最终,该研究选择了基于梯度提升分类器(GBC)的模型,并从训练队列中筛选出11个关键变量用于识别中重度肝脏炎症。
研究结果显示,GBC模型在训练队列中的AUC范围为0.62~0.86,在两个独立外部验证队列中的AUC范围分别为0.61-0.89和0.72~0.78,表明该模型具有较好的诊断性能。特别是,在HBV DNA ≥105 IU/ml的患者中,GBC模型展现了最高的诊断效能,AUC值在训练队列和两个外部验证队列中分别达到了0.87、0.90和0.79。
此研究的重要性在于它不仅提供了一种精准、无创的诊断工具来评估CHB合并HS患者的肝脏炎症严重程度,还通过其在不同亚组中的表现,证明了模型的可推广性和稳定性。此外,研究团队建立的免费网站为临床医生使用该模型提供了便利,进一步增强了其临床应用价值。
综上所述,这项研究不仅因其创新的方法论和显著的临床意义受到关注,更因其在机器学习在慢性疾病管理中应用的先进性而具有里程碑意义。
慢性乙型肝炎(CHB)和肝脂肪变性(HS)的共存问题日益成为医学研究的重点。这两种疾病都是慢性肝损伤的主要原因,不仅增加了患者罹患肝硬化和肝细胞癌的风险,而且对患者的生活质量造成了重大影响。在这种背景下,我们在中国11家医疗中心联合进行的回顾性、多中心的队列研究,开启了一项旨在通过无创方式准确诊断CHB合并HS患者肝脏炎症严重程度的研究。
该研究涵盖了2004年4月至2022年9月期间1787例未经抗病毒治疗的CHB合并HS患者。通过采用shapley additive explanations方法评估23个特征在诊断中重度炎症的重要性,并使用七种机器学习方法构建模型,最终选择了GBC模型来识别中重度炎症。这项研究不仅表明了机器学习技术在医学领域应用的巨大潜力,也为临床医生提供了一个强有力的工具,使他们能够更早、更准确地诊断并管理CHB和HS患者。
从这项研究中,我们可以汲取到深刻的启发。首先,它强调了跨学科合作在解决复杂医学问题中的重要性。通过结合医学专业知识和先进的机器学习技术,研究团队能够开发出一种新的诊断工具,这一工具提高了诊断的准确性。其次,这项研究体现了科技进步在改善公共卫生领域中的作用。通过建立一个免费网站,使得这一先进的诊断工具能够被更广泛地应用。
另一方面,通过无创的诊断方法,减少了患者的痛苦和风险,显示了医学研究以患者为中心的理念。总之,这项研究不仅是一个科学上的成就,也是医学人文关怀的体现。它不仅为慢性肝病的诊断和治疗提供了新的思路和工具,而且也为医学研究提供了新的方向。
南京大学医学院附属鼓楼医院,感染科科主任,主任医师,博士,博士后,博士生导师,美国斯坦福大学访问学者、中国香港大学 Research Fellow。擅长新发传染病、病毒性肝炎、脂肪性肝病的临床诊疗及免疫发病机制。主持国家自然科学基金4项。2018年获山东省首届“齐鲁卫生与健康领军人才培育工程杰青人才”称号,2022年获“江苏特聘医学专家”称号。2023年获“江苏省双创人才”称号。以第一作者/通讯作者在The Lancet Gastroenterology & Hepatology、Protein & Cell、JAMA Network Open、Hepatology、Clin Gastroenterol Hepato、American Journal of Gastroenterology、Diabetes Care等国际权威杂志发表SCI论文58篇。
杭州师范大学附属医院,肝病科,主任医师,教授,科教科科长,博士后,博士生导师。擅长治疗各型肝炎,尤其是在脂肪肝和酒精性肝病诊断和治疗上有较深的造诣。近年来先后主持和参加了包括国家自然科学基金、科技部863项目等资助的15项课题,在SCI收录、国家级、省级医学刊物以及AASLD、EASL等国际会议上共发表论文100余篇,主编和参编专著5本。曾获浙江省科学技术进步奖三等奖1项,杭州市科学技术进步奖二、三等奖各1项,浙江省中医药科技创新二、三等奖各1项。
上海交通大学医学院附属瑞金医院感染科科主任、传染病与流行病学教研室主任、巴斯德研究所客座教授、博士生导师、主任医师。多年来主要从事传染病学专业,尤其是病毒性肝炎的临床和基础研究。现任瑞金医院感染科主任、博士生导师、上海市肝病研究中心专家委员会常务委员、上海市中医药学会感染病分会委员、《肝脏》杂志编辑委员会委员、卢湾区政协委员。作为主要成员参与了国家卫生部“七五”、“八五”重型肝炎攻关课题和上海市科委等其他多项课题的研究。目前作为负责人承担了两项国家自然科学基金项目以及一项上海市高校青年科学基金项目。曾先后在专业杂志上发表论文30余篇。
南京中医药大学鼓楼临床医学院2022级博士研究生,以第一作者及共同第一作者发表SCI论文4篇,核心期刊论文数篇。参与多项国家级、省部级课题研究。
洛杉矶Cedars-Sinai(西达赛奈)医院消化科在训。毕业于中国台湾国防医学院、牛津大学,博士后研究师从斯坦福大学Mindie Nguyen教授。专注于肝病领域的流行病学、临床医学以及机器学习的研究。2019年获美国肝病学会颁Emerging Liver Scholar。以第一和通讯作者发表在JAMA Oncology、Journal of Hepatology、Gastroenterology、Gut、Hepatology、AJG 等98篇文章,引用4161次。
天津市第二人民医院,慢性肝病科暨肿瘤微创治疗科(科主任)、脂肪肝诊疗中心,主任医师,博士,硕士生导师,Memorial University访问学者。擅长病毒性肝炎、自身免疫性肝病、脂肪性肝病、肝癌等多种慢性肝脏疾病的诊治。主持各项科研基金4项,参与国家十三五等课题12项,天津市科技进步二等奖1项,Hepatology、AP&T、DIGEST LIVER DIS、中华肝脏病杂志等文章20余篇。
我们的研究团队汇集了来自中国六个省市的科研团队,共同组成了一个跨地区、多学科的协作网络。团队成员包括:南京大学医学院附属鼓楼医院李婕教授团队、杭州师范大学附属医院施军平教授团队、上海交通大学医学院附属瑞金医院谢青教授团队、天津市第二人民医院徐亮教授团队、福建医科大学第一附属医院郑琦教授团队、郑州大学第一附属医院曾庆磊教授团队、镇江第三医院谭友文教授团队、台州恩泽医院何泽宝教授团队、无锡市第五人民医院邱源旺教授团队、苏州大学附属传染病医院朱传武教授团队和淮安市第四人民医院李晶教授团队。
这支多中心团队致力于慢性乙型肝炎和肝脂肪变性研究,通过资源共享和专业知识交流,旨在开发新的慢性乙型肝炎和肝脂肪变性患者肝脏炎症的诊断工具和治疗策略,展现科研与临床实践的结合力量。
每一项临床研究都倾注着研究团队的心血结晶。学习过后,您是否有所收获?或有疑问想与主创团队分享?请在评论区留言,期待与您交流!
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