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与帕金森病相关的结构、拷贝数变异和动态突变被发现

2024-07-29作者：静科研

非原创

（通讯员王朝东王蕾）帕金森病（PD）是一种常见的老年神经退行性疾病。近年来国内外大样本全基因组关联分析（GWAS）等研究发现了系列与PD相关的单核苷酸变异（SNP），但基因组上的结构变异、拷贝数变异和短串联重复变异与PD的关系仍不明确。2024年7月23日，首都医科大学宣武医院神经内科王朝东教授和陈彪教授，联合华大基因研究院张建国研究员和刘汉奎助理研究员，在国际著名期刊《npj Parkinson’s disease》（Nature子刊）在线发表了题为”High-depth whole-genome sequencing identifies structure variants, copy number variants and short tandem repeats associated with Parkinson’s disease”的研究论著（https://www. nature.com/articles/s41531-024-00722-1）。王朝东教授、刘汉奎研究员为共同第一作者，陈彪教授和张建国研究员为共同通讯作者。该研究受国家重点研发计划项目(2021YFC2501200；2018YFC1312001)和国家自然科学基金面上项目（82371259; 82171412）资助。

该研究首次通过高深度全基因组测序，联合长读长、Sanger测序和定量PCR（qPCR）等技术确认了MUC19基因上1.6kb缺失变异、RXFP1基因上的12.4kb拷贝数变异和SLC2A13基因上的GGGAAA重复数目与帕金森病显著相关。同时，发现SLC2A13和MUC19基因分别位于LRRK2基因的上下游，5拷贝的GGGAAA重复单元扩增和缺失型MUC19结构变异显著降低了LRRK2 G2385R（最常见的东亚人群帕金森病相关变异）的发病风险。这一发现首次为G2385R找到了遗传修饰因素，也为其临床上表现的相对低外显率提供了解释。此外，研究团队还发现，人类染色体两端5Mb的区间内帕金森患者的拷贝数变异负荷显著更高。而且随着年龄的增长，健康对照的染色体末端CNV负荷也随之升高，提示了染色体端粒变异、衰老和帕金森病的关系。

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