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成果名称:在细胞遗传学正常的成人急性髓性白血病患者中,DEAD/H-box解旋酶11突变与复发风险增加相关
发表期刊:《白血病》[Leukemia,IF(2022):11.4]
通讯作者:黄晓军,阮国瑞
第一作者:周亚兰,赵鸣悦
主要作者单位:北京大学人民医院血液科
本研究首次发现DDX11突变与细胞遗传学正常的急性髓系白血病复发相关,并证实其中部分为胚系突变,这对白血病患者精准诊疗及全球应用最广泛的半相合干细胞移植实施“北京方案”中优选供者,以提高患者生存期,具有重要的意义。
成人细胞遗传学正常的急性髓系白血病(CN-AML)是最常见的血液恶性肿瘤之一,其遗传背景及临床预后具有高度的异质性,按照欧洲白血病网(ELN)危险度分级,仍有部分被评估为预后较好的患者会复发,复发仍然是严重制约其长期预后的关键因素,根本原因在于精准诊断和个体化治疗仍存在盲区。发现并验证新的复发相关分子标志物,是推动其精准诊疗的关键途径之一。
在我们前期开展的工作中(Blood. 2018;132, Supplement 1:2813),通过对23例复发成人CN-AML患者初诊、缓解及复发时期三重配对的骨髓DNA样本进行全外显子组测序,筛选出多个潜在的AML复发相关基因,其中包括鲜见报道的DDX11基因突变(图1)。DDX11基因编码一种铁硫簇DNA解旋酶,促进染色质结构的维持和DNA的修复,在维持基因组稳定中起到重要作用。已有报道DDX11双等位基因突变导致一种罕见的常染色体隐性遗传病-华沙断裂综合征。DDX11体细胞突变与骨髓增生异常综合征和淋巴系统肿瘤的不良生存有关。然而,目前关于DDX11突变对AML预后的影响鲜见报道。
我们在前期研究的基础上,进一步研发出包含DDX11在内的236个基因高通量靶区测序Panel,借助于该Panel对423例初诊CN-AML骨髓DNA样本进行高深度基因序列分析,发现DDX11突变在CN-AML中频繁发生,DDX11突变组患者更多地集中在ELN危险分层的中危组。多因素预后分析表明,DDX11突变与较高的累积复发率、较差的总生存相关(表1,图2)。通过对部分家系口腔黏膜样本的联合基因序列分析,证实部分DDX11突变为胚系突变(图3),这对白血病患者精准诊疗及全球应用最广泛的半相合干细胞移植实施“北京方案”中优选供者,以提高患者生存期,具有重要的意义。该研究结果于2023.11.22在线发表于Leukemia(Q1)。
图1. 1例AML患者从初诊到第一次巩固化疗后复发再到移植后复发的克隆演变过程,其中DDX11的获得性突变为化疗后复发的特异性突变之一。
——Zhou YL, Huang XJ, Ruan GR*, et al. Blood. 2018; 132 (Supplement 1): 2813.
图 2. DDX11突变对CIR和RFS的影响。A. DDX11野生型和突变型队列的CIR。B. DDX11野生型和突变型队列的RFS。C. DDX11野生型、体细胞突变型、胚系突变型队列的CIR。D. DDX11野生型、体细胞突变型、胚系突变型队列的RFS。
图3. DDX11突变位点及变异等位基因频率(VAF)。A. DDX11在初诊时的突变位点:不同的突变类型由图形标识,不同图形的个数表示该位点突变的病例数,图形颜色表示突变类型;B. VAFs的分布:每行表示一个样本的数据;根据VAFs,VAFs > 30%的突变被认为是可能的胚系突变(红色),而VAFs < 30%的突变可能是体细胞突变(蓝色)。
表1. DDX11突变对CIR和RFS影响的多因素分析
阮国瑞研究员:
随着研究的不断深入,越来越多的分子学标记得以发现,助力成人细胞遗传学正常的急性髓系白血病这一具有临床和分子生物学背景高度异质性的疾病亚群的精准诊疗。
本研究在前期研究的基础上进一步扩展,首次发现DNA解旋酶DDX11基因在成人细胞遗传学正常的急性髓系白血病中与较高的复发风险相关,为临床诊疗提供参考依据。另一方面,本研究通过家系成员口腔颊黏膜对照样本及不同诊疗时期样本中突变负荷分析,发现部分DDX11突变为潜在的胚系突变,亦与不良预后相关,这对急性髓系白血病患者精准诊疗以及全球应用最广泛的半相合干细胞移植实施“北京方案”中优选供者,以提高患者生存期,具有重要的意义。
但本研究尚存在一定的局限性:1.回顾性分析资料,患者接受化疗或移植并非完全随机;2. 临床队列相对还不够大,阳性病例例数尚需进一步积累以更好的分析DDX11突变组患者特异性临床特征。因此,本研究的结论尚需在更大的前瞻性临床队列研究中进一步验证。
该论文前期相关研究结果曾连续两年获得第60、61届美国血液学年会摘要成就奖:
1. Yalan Zhou, Lixin Wu, Robert Peter Gale, Runqing Lu, Jinlan Li, Hao Jiang, Qian Jiang, Bin Jiang, Zilong Wang, Tingting He, Yue Wang, Xiaoxiao Zhang, Xiaohui Zhang, Lanping Xu, Kaiyan Liu, Xiaojun Huang, Guorui Ruan*. Clonal trajectories in persons with acute myeloid leukemia and normal cytogenetics relapsing after intensive chemotherapy and after allotransplants. Does pretransplant conditioning contribute to mutation topography? Blood. 2018; 132 (Supplement 1): 2813.
2. Yalan Zhou, Lixin Wu, Robert Peter Gale, Zilong Wang, Jinlan Li, Hao Jiang, Qian Jiang, Bin Jiang, Sanbo Cao, Ying Sun, Feng Lou, Chengcheng Wang, Yanrong Liu, Yu Wang, Yingjun Chang, Lanping Xu, Xiaohui Zhang, Kaiyan Liu, Guorui Ruan*, Xiaojun Huang*. Dead/H-box helicase 11 (DDX11) mutations correlate with increased relapse risk in persons with acute myeloid leukaemia and promote proliferation and survival of human AML cells in vitro and in immune deficient mice. Blood. 2019;134 (Supplement 1): 2732.
该论文前期相关研究结果已申请两项专利,其中一项已授权并转化:
1. 一种对NPM1基因突变细胞遗传学正常的急性髓系白血病患者危险分层的装置(受理号:202211170341.4),发明人:黄晓军,阮国瑞,赵鸣悦,曹雷茗。
2. 一种正常核型AML患者预后风险评估标记物及其应用(专利号:ZL 201910496712.X,发明人:黄晓军,阮国瑞,周亚兰,江浩,吴利新,王子龙。已于2023年5月8日转让给北京金域医学检验实验室有限公司产业化)。中国工程院院士,北京大学博雅讲席教授
现任北京大学人民医院血液科主任,北京大学血液病研究所所长,国家血液系统疾病临床医学研究中心主任。2022年获聘中国医学科学院学术咨询委员会学部委员,2023年当选中国工程院院士。
黄晓军教授长期聚焦白血病等其他恶性血液疾病的前沿研究和临床治疗,创建骨髓移植中国科学新方案—“北京方案”,解决了“供者来源匮乏”这一世界性医学难题,使亲属成为移植供者的概率由不足25%上升至几乎100%;显著提高了患者生存,使半相合移植治疗白血病的3年生存率从约20%升至70%左右。北京方案改变了世界半相合移植“不可逾越”的传统观念,使半相合移植成为白血病一线治疗方案,促进了全球白血病和骨髓移植学科的在最近20年的长足进步。
先后获国家科技进步奖二等奖2项、省部级一等奖4项、何梁何利科学技术与进步奖,谈家桢生命科学临床医学奖,转化医学杰出贡献奖,吴阶平医药创新奖,中国工程院光华工程科技奖。
兼任亚太血液联盟常委会主任、世界华人医师协会第四届理事会副会长、第四、五届中国医师协会血液科医师分会会长、第九届中华医学会血液学分会主委等。
研究员,博士生导师
国家血液系统疾病临床医学研究中心
北京大学血液病研究所
北京大学人民医院
学术兼职:
中国实验血液学杂志编委
国家药监局医疗器械技术审评中心外聘专家
国家自然科学基金、科技部、教育部、北京市科委等项目/成果评审专家
Leukemia、Molecular Diagnosis & Therapy、中华医学杂志(英文版)、中华医学会系列期刊等评审专家
北京大学人民医院学术委员会科学研究委员会主审委员
研究方向:
恶性血液病分子标记物的基础与临床
主持/承担国家973计划、国家自然科学基金、教育部高校博士点基金、北京市自然科学基金等多项研究,在Molecular Cancer、Journal of Hematology & Oncology、Leukemia等国内外杂志发表论文90余篇;已申请并授权相关专利30余项,其中多项转化应用,并在血液肿瘤精准诊断、预后评估、微小残留病监测及治疗方案选择中发挥重要作用;曾获省部级科技进步奖、北京大学产学研项目合作先进个人奖、北京大学医学部发明专利奖等30余项;在国际上首先发现了十种新的血液肿瘤相关基因突变,并被美国国立生物技术信息中心收录。
2017-2020年在北京大学人民医院血液科攻读博士学位,期间荣获北京大学三好学生、北京大学仲外优秀医学奖学金、北京大学进知德善优秀医学生奖学金、北京大学2020年优秀博士毕业生及北京大学优秀博士论文等荣誉。
主持国家自然科学基金青年项目1项。
导师:阮国瑞
国家血液系统疾病临床医学研究中心,北京大学人民医院,北京大学血液病研究所,2021级科研型博士研究生
导师:阮国瑞
该团队依托国家血液系统疾病临床医学研究中心,北京大学血液病研究所,阮国瑞研究员作为国家血液系统疾病临床医学研究中心PI,其课题组长期致力于血液肿瘤分子标记物基础与临床研究。在国际上首先发现两种新的NPM1突变、八种新的CALR突变、急性髓系白血病中存在DDX11突变、多种新的淋系及多发性骨髓瘤分子标记物。研发的多种新的分子标记物及其检测技术目前已在临床广泛应用,极大地促进了血液肿瘤精准诊疗的发展。
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