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mNGS在血液病患者感染病原诊断中应用的16条共识!|指南共识

2023-10-19作者:论坛报木易资讯
非原创

血液病患者因原发病和(或)治疗相关原因等,免疫功能低下,感染是其常见的并发症。血液病患者感染相关临床症状和体征常不典型,感染病原谱广,传统微生物学检测阳性率低、耗时长。因此,病原诊断是优化抗感染治疗、改善患者预后的关键环节。病原宏基因组二代测序(mNGS)是一项覆盖病原谱广且高通量的检测技术,已在临床感染领域得到了广泛的应用。在血液病患者感染病原诊断方面,mNGS检测具有阳性率高、受到抗菌药物干扰小、覆盖病原广的优势。

一、
血液病患者感染临床送检mNGS适应证




共识1:感染是血液病患者常见的并发症,当疑似感染发生时,应首先选择传统微生物学检测,仅在特殊情境下谨慎选择病原mNGS检测(图1)。

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图1 血液病患者病原宏基因组二代测序(mNGS) 送检流程图

注:a特殊样本包括组织、骨髓、穿刺液、支气管肺泡灌洗液等无菌来源或不易重复获取的样本



(一)中性粒细胞缺乏(粒缺)伴发热

共识2:低危且无明显感染灶的患者,如经验抗菌药物治疗≥7 d未明显好转可考虑在送检血培养的同时送检外周血标本mNGS;高危患者初始经验性治疗72~96 h无效时,推荐送检传统微生物学检测的同时送检血液mNGS。


(二)血流感染(BSI)

共识3:疑似BSI患者,在留取血培养标本的同时留取血浆样本,于-80 ℃暂存;如72 h内血培养阴性且抗感染治疗无改善的患者,推荐将留存样本进行mNGS。疑似脓毒症的重症患者,建议送检血培养同时送检血mNGS。


(三)下呼吸道感染

共识4:下呼吸道感染患者首选支气管肺泡灌洗液(BALF)送检传统微生物学检测,难以进行支气管肺泡灌洗的患者,可以选择深部痰进行检测,并同时留取标本冻存。如抗感染治疗≥72 h感染症状无好转或影像学表现持续加重的患者,建议送检留存标本行mNGS检测。如为重症下呼吸道感染或有快速进展为重症的危险因素患者,建议同时送检传统微生物学检测及mNGS。


(四)中枢神经系统感染(CNSI)

共识5:疑似CNSI,推荐脑脊液在送检传统微生物学检测的同时送检mNGS,在流程上建议选择DNA检测,仅在考虑RNA病毒感染时完善RNA检测流程。



(五)肠道或腹腔感染

共识6:疑似肠道感染患者推荐首选传统微生物学检测,粪便样本病原mNGS检测可作为补充。疑似腹腔感染,首选感染部位样本送检,如不能获得感染部位样本可选择血液样本送检,但检出性能有限,不作为常规推荐。



(六)皮肤软组织感染

共识7:推荐对累及深部或播散性的皮肤软组织感染患者,在完善感染部位标本传统微生物学检测的同时送检mNGS,如不能获得感染灶局部样本,可选择外周血。



(七)泌尿系统感染

共识8:对于复杂性泌尿系统感染、移植后泌尿系统感染在完善传统微生物学检测后不能获得病原学证据或治疗不佳的患者可尝试尿液mNGS。



二、
样本采集与质量控制




共识9:对于病原mNGS检测样本,应首选从感染部位直接采集,若无法采集可考虑外周血标本送检。



三、
报告解读


共识10:致病性明确且罕见定植的微生物,低序列检出也应考虑其为致病菌可能。

共识11:无菌采集获得的样本检出病原,应结合临床考虑致病微生物的可能,但需注意排除定植。

共识12:外周血样本mNGS报告中DNA类病毒检出常见,并非均为感染病原。

共识13:非无菌样本的结果应结合临床、标本类型、传统微生物学检测结果共同判断

共识14:耐药基因的检出,应在充分考虑基因型与耐药表型对应性的基础上进行判断。

共识15:病原mNGS检测属于定性检测范畴,序列高低不等同于体内病原载量。

共识16不推荐将mNGS阴性作为排除感染的标准。





(执笔:徐春晖、林韧)

来源:中华医学会血液学分会抗感染学组. 宏基因组二代测序技术在血液病患者感染病原诊断中的应用中国专家共识(2023年版)[J]. 中华血液学杂志,2023,44(08):617


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