查看更多
密码过期或已经不安全,请修改密码
修改密码壹生身份认证协议书
同意
拒绝
同意
拒绝
同意
不同意并跳过
血管组 洪澜
全基因组关联分析(genome wide association study, GWAS)目前已被广泛应用于基因组学的研究中,用以探究基因层面的疾病危险因素。目前已知的与心源性卒中(cardioembolic stroke, CES)相关有8个基因位点,包括ABO,ZFHX3,PITX2,NKX2-5,RGS7,GNAO1,PHF20以及5q22.3。在传统GWAS基础上进行的多性状分析(multi-trait analysis of GWAS, MTAG)相比于传统的GWAS,有更强的统计学效力,允许样本重叠,同时也能在基因层面上将性状与位点联系起来,在不同的性状间进行独立分析。来自西班牙的团队在2021年ESOC上分享了CES多性状分析的研究结果。
该研究对两个性状进行了探索。其一为CES,使用的是MEGASTROKE数据库(简称为MEGASTROKE-CES, Malik et al. Nat Genet. 2018),包含了7193名CES患者; 第二个性状为房颤,使用的是欧洲的房颤患者队列数据库(简称为AF-2018,Nielson et al. Nat Genet.2018),包含了60620名房颤患者。通过GWAS-pairwise的方法,明确两个性状共同的位点,以及各自单独的位点,并通过独立队列的GWAS分析来重复性验证与CES相关的基因位点。
研究通过861823份样本,确认了44个与CES相关的基因位点,值得注意的是,之前研究确认的RGS7不在这44个位点之中。经过伪发现率校正后,有85个基因集与CES显著相关,主要与心肌细胞运动、收缩、传导以及动作电位有关。研究确认了51个只与房颤相关的基因位点(与CES关联性较低)。经过伪发现率校正后,有25个基因集与房颤显著相关,主要与心脏的发育、成形、分化有关。
研究通过进一步独立队列进行重复性验证分析。独立队列包括了1515名CES患者和5626名对照人群,1110例AF患者和7791例对照。有11个位点被发现有统计学意义,其中8个是首次发现,包括CAV1,IGF1R,KIAA1755, NEURL1,PRRX1,SYNE2,TEX41以及WIPF1。其中KIAA1755已被证明与心率,PR间期相关,同时还可能与卒中梗死体积有关。皮尔森相关性分析显示MTAG-CES分析与独立队列分析结果显著相关。
本研究的新意在于使用多性状分析首次发现8个与CES相关的位点,为CES的病理生理机制提供新的角度,为未来的功能性试验提供新的可能。
查看更多