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2020年3月19日,云南大学张志刚团队在Current Biology 在线发表题为“Probable Pangolin Origin of SARS-CoV-2 Associated with the COVID-19 Outbreak”的研究论文,该研究对之前发表的马来穿山甲病毒组学数据(该数据由2019年3月24日无法救护成功的穿山甲肺的样本获取)进行重新组装和全面系统地分析,发现这批马来穿山甲携带SARS-CoV-2相近的冠状病毒(命名为Pangolin-CoV),其与SARS-CoV-2和BatCoV RaTG13的基因组相似性分别为91.02%和90.55%。除RaTG13外,Pangolin-CoV与SARS-CoV-2最紧密相关。Pangolin-CoV的S1蛋白与SARS-CoV-2的关系比与RaTG13的关系密切得多。Pangolin-CoV和SARS-CoV-2之间与人ACE2相互作用涉及的五个关键氨基酸残基是完全一致的,但在RaTG13中存在四个氨基酸突变。可以在SARS-CoV-2中观察到的Pangolin-CoV和RaTG13在S1 / S2切割位点都丢失了假定的Furin蛋白酶识别序列基序。总而言之,这项研究表明穿山甲物种是SARS-CoV-2的天然库。同时,该研究也呼吁加强野生动物保护和管理,保护野生动物,就是保护人类自己。
与SARS-CoV和MERS-CoV的情况相似,蝙蝠仍然是2019年新型冠状病毒(SARS-CoV-2)的可能起源物种。然而,SARS-CoV和MERS-CoV通常在进入人类之前先进入中间宿主,例如果子狸或骆驼。这一事实表明,SARS-CoV-2可能是通过其他动物传播给人类的。考虑到最早的冠状病毒病2019(COVID-19)患者报告未在海产品市场上暴露,因此找到中间的SARS-CoV-2宿主来阻止种间传播至关重要。
2019年10月24日,来自中国广东省野生动物救助中心的Liu及其同事首次从两只死去的马来亚穿山甲的肺部样本中发现了SARS-CoV样冠状病毒,其肺部有泡沫液体,并有肺纤维化,并且这个事实是在COVID-19爆发发生时发现的。使用他们发表的结果,进行重新组装和全面系统地分析,发现这批马来穿山甲携带SARS-CoV-2相近的冠状病毒(命名为Pangolin-CoV),其与SARS-CoV-2和BatCoV RaTG13的基因组相似性分别为91.02%和90.55%。
具体来说,在全基因组水平上,Pangolin-CoV与SARS-CoV-2和BatCoV RaTG13相似性分别为91.02%和90.55%。除RaTG13外,Pangolin-CoV与SARS-CoV-2最紧密相关。Pangolin-CoV的S1蛋白与SARS-CoV-2的关系比与RaTG13的关系密切得多。Pangolin-CoV和SARS-CoV-2之间与人ACE2相互作用涉及的五个关键氨基酸残基是完全一致的,但在RaTG13中存在四个氨基酸突变。
可以在SARS-CoV-2中观察到的Pangolin-CoV和RaTG13在S1 / S2切割位点都丢失了假定的Furin蛋白酶识别序列基序。总而言之,这项研究表明穿山甲物种是SARS-CoV-2的天然库。
该研究首次全面澄清了SARS-CoV-2与穿山甲冠状病毒(Pangolin-CoV)、蝙蝠冠状病毒(RaTG13)、2003年非典型肺炎冠状病毒(SARS -CoV)以及2015年中东呼吸综合征冠状病毒(MERS-CoV)的关系,认为除了蝙蝠和穿山甲之外,SARS-CoV-2还存在其它未知中间宿主,为进一步攻克病毒源头和传播路径提供了宝贵的参考。同时,该研究也呼吁加强野生动物保护和管理,保护野生动物,就是保护人类自己。
参考消息:
(20)30360-2
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