壹生资讯-Q37：正常人脑脊液NGS能否检出病毒核酸？

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Q37：正常人脑脊液NGS能否检出病毒核酸？

2021-01-26作者：论坛报小塔资讯

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问：正常人脑脊液NGS能否检出病毒核酸？

施毅教授：

在感染性疾病领域，二代测序技术（NGS，Next-Generation Sequencing）主要指病原微生物的宏基因组检测技术，能够检测到目前我们所有能够检测到的病原体。当然这种检测技术也会受一些因素影响，例如不同病原体的细胞壁厚薄不一样，有些细胞壁特别厚而难以破壁的病原体，可能会检测不出来或者不敏感；对于一些很容易破壁的病原体则很容易就能够检测出来。

临床常见的病原体包括：细菌、真菌、病毒、寄生虫、支原体、衣原体和立克次体等。在中枢神经系统感染中，NGS对细菌、寄生虫和病毒感染的检测效果较好，而对真菌感染的检测效果要稍微差一点，目前尚缺乏大样本研究证据。

对于脑脊液NGS，如果不考虑病原体，只考虑脑脊液，应该都是可以检测到的。然而脑脊液中有很多背景细胞，也会有DNA抽提出来，从而干扰对病原微生物的检测。

需要注意的是，病毒分为DNA病毒和RNA病毒，不建议用NGS检测DNA病毒。但当临床上高度怀疑是病毒性脑炎时，应当同时检测DNA和RNA来确定是否存在病毒感染，以免遗漏可能的RNA病毒感染。

指导专家：南京大学医学院附属金陵医院呼吸与危重症医学科施毅

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