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2022-12-17作者：论坛报木易资讯

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mNGS在急危重症感染患者应用的适应证

对于急危重症患者要掌握mNGS的适应证。有关急危重症感染患者mNGS的应用原则、注意事项、操作流程和临床解读见图1。根据目前的临床经验、研究结果和mNGS技术的优势，推荐mNGS在急危重症感染患者中应用的主要适应证：

① 病情危重需要尽快明确病原体；

② 特殊病人如免疫抑制宿主、合并基础疾病、反复住院的重症感染患者需要尽快明确病原体；

③ 传统微生物检测技术反复阴性且治疗效果不佳；④ 疑似新发病原体、临床上提示可能有一定的传染性；

⑤ 疑似特殊病原体感染；

⑥长期发热和/或伴有其他临床症状、病因不明的感染。符合以上适应证的患者，应尽快送标本进行检测。

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图1 急危重症感染患者mNGS的应用原则、注意事项和报告解读流程

mNGS在急危重症感染性疾病应用中尚存在的问题

（1）背景菌

在阅读报告时，要结合采集样本类型、微生物背景、患者的临床特征、传统的病原体检测报告和辅助检查等判断是定植菌、背景菌还是致病菌。对于mNGS的检测报告，检测机构必须尽可能提供检测列表，而不是做出判断，由临床医生结合检测结果和临床病史做出判断。

（2）胞内菌/真菌检出率低

对于胞内感染菌因释放到体液中含量较少而导致检测敏感性偏低，比如结核分枝杆菌、军团菌、布鲁菌等。但是随着检测技术的优化与样本类型选择的逐渐完善，mNGS诊断胞内菌感染的敏感性越来越高。另外，mNGS对具有较厚细胞壁的病原微生物如真菌感染，其核酸提取效率较低，导致临床检出率和敏感性较低。

（3）RNA病原体的检测

由于人体RNA转录本身具有比基因组更高的丰度和复杂度，另外RNA容易降解，对运输和保存的要求较高，因此RNA病毒的临床检测还存在一定的困难，尚需要不断优化RNA病毒的送检流程。

（4）耐药检测

目前使用mNGS进行药敏检测还存在一定的困难，一是目前报道的耐药基因型与耐药表型的关联程度还存在一些差距；二是现有检测方法因成本考虑导致耐药相关基因覆盖度较低，难以高灵敏度地检测出相关耐药基因，随着技术进步，耐药基因高覆盖度的mNGS检测技术将会形成。

本文节选自《宏基因组分析和诊断技术在急危重症》

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