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真菌直接镜检操作简便、适用于多种临床样本［支气管肺泡灌洗液（BALF）、痰液、尿、粪、分泌物、脑脊液、引流液等］、可快速报告结果，有重要临床价值，但存在假阴性、敏感性不高等问题。
怀疑真菌感染患者BALF及无菌体液（除血液外）标本，应做真菌直接镜检，同时做真菌培养及血清学检查。
非无菌部位标本（痰、尿、粪等），如果做真菌培养，需要在培养同时做真菌直接镜检。
真菌直接镜检敏感性不高，多次送检能提高检出率。
活检组织标本在进行组织病理和真菌培养检查的同时，应做直接压片，荧光染色后进行真菌直接显微镜检查。
荧光染色可显著提高真菌镜检的敏感性，临床应用价值更大，但需要注意：在皮肤、呼吸道等非无菌部位，荧光染色检查发现个别孢子有可能是定植真菌，非致病真菌，需要结合临床综合判断。呼吸道标本的直接涂片镜检也可以采用革兰染色。怀疑肺孢子菌肺炎的患者，对诱导痰或BALF涂片后进行六胺银染色（GMS）。怀疑隐球菌性脑膜炎患者，脑脊液直接真菌镜检一般采用墨汁染色。
真菌直接镜检报告阴性，由于敏感性问题，不能完全排除真菌感染。报告阳性时，如果是无菌部位标本，可以确诊存在真菌感染，但确认致病真菌种类还需要真菌培养结果；如果是非无菌部位，则需要结合患者免疫状态、临床表现、真菌培养结果及真菌血清学检查综合判断；BALF来源于肺部，非完全无菌部位，但免疫抑制人群（尤其是血液病、骨髓移植、化疗患者）出现阳性结果，且根据镜检时真菌形态提示为曲霉时，对诊断肺曲霉病有重要意义；对于痰、尿、粪等非无菌标本，真菌直接镜检阳性，根据形态提示念珠菌时，要考虑局部真菌定植问题。鼻窦组织标本由于培养阳性率较低，更建议做真菌直接镜检。少量肺部穿刺组织直接压片，进行荧光染色后镜检，可快速发现肺部曲霉或毛霉等丝状真菌感染，有确诊意义，适用于高度怀疑肺部真菌感染患者。
真菌直接镜检中真菌形态的描述对某些菌种有提示意义，但不能替代真菌培养。
本文节选自《侵袭性真菌病实验室诊断方法临床应用专家共识》
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