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重症肺炎指的是社区获得性肺炎（CAP）的重症形式，根据肺炎严重度指数（PSI）或CURB-65评分，评分越高，病死率越高。但由于重症肺炎的临床研究较少，临床医生对重症肺炎的诊治尚存在一些困惑。
疾病易感性或基因多态性
肺炎与重症肺炎患者存在基因多态性，与急性呼吸窘迫综合征（ARDS）的研究结果有些类似，如PAI-1，TNFR，FCGR2A, C1QBP，TRPM2等均与肺炎的严重程度或易感性有关。笔者团队之前对一组H7N9患者的外显子进行测序分析，发现了23个易感基因，这些基因有些与凝血纤溶活性有关，有些与免疫功能激活有关，有些与炎症因子释放有关，都参与了重症肺炎的发生发展。了解基因多态性与重症肺炎的关系，有利于更精准地掌握和预测发病及预后，甚至开发出新的治疗方法。
重症肺炎的微生物诊断
微生物诊断方法的改进有力推动了病原学诊断的敏感性和特异性，指导了临床抗生素的应用。Gene-Xpert、16sRNA、PCR、二代测序等方法的应用，提高了临床诊治水平，尤其对某些疑难疾病的诊断。但由于分子诊断需要一定的实验室条件，需要严格的质量控制，包括采样防污染，核酸提取效率及防污染，计算方法和阈值界定等，都需要经验积累、广泛验证并规范化操作。未来，分子诊断将是提高重症肺炎诊治水平的关键一环。
抗生素合理使用
随着耐药菌的出现，优化药代学（PK）/药效学（PD）成为治疗危重感染的常态。需要从以下3方面考虑抗生素的使用：① 病原学方面要参考最低抑菌浓度（MIC）的数值；② 宿主方面要参考代谢脏器的功能；③ 药物的PK/PD。此外，必要时检测药物浓度和药物代谢基因，有利于抗生素的个体化使用。
非抗生素药物的开发
一些针对细菌毒素的中和抗体开发，例如人源化抗病毒的单克隆抗体、针对重症肺炎病理生理变化的抗凝药物、免疫调节剂、生长因子，间充质干细胞等都显示出一定的治疗效果。从病原体到宿主炎症免疫反应和凝血纤溶等，都是这些非抗生素类药物干预重症肺炎的重要靶点。
免疫状态监测与调节
目前尚缺乏判断重症肺炎患者免疫功能状态的金标准。HLA-DR、特异淋巴细胞计数、免疫组库特征、IL-10水平等可作为免疫功能的参考，未来还需要建立一套客观的、动态的免疫功能检测生物标记物，以便激素和免疫调节剂的合理使用。
脏器功能保护
保护性肺通气，俯卧位改善引流，合理的补液，镇静剂的使用，必要时的体外膜氧合（ECMO）使用等均需要确定合适的使用指证，有利于重症肺炎患者脏器功能的保护和修复。
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