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儿童呼吸道感染病原体核酸检测的标本类型

2022-03-17作者:论坛报木易资讯
感染非原创

呼吸道病原体核酸检测推荐人群

根据各种核酸检测方法的优缺点,对呼吸道病原体核酸检测适用的人群推荐如下。


门诊患儿 

(1)急性上呼吸道感染患儿,一般不常规进行呼吸道病原体的核酸检测,但对于有特异性抗病毒药物的病毒感染,如流感病毒,可视条件或在其他检测方法不能明确诊断时,使用核酸检测,有利于抗病毒药物的合理应用。

(2)急性下呼吸道感染患儿,或有心肺等重要脏器的基础疾病、免疫功能异常的急性呼吸道感染患儿,建议根据患儿年龄、临床特征和发病季节等及时选用可疑病原的核酸检测方法进行病原学确定,尽快明确病原体,有助于患儿治疗方案的确定和后续管理。

急诊及住院患儿 

(1)对有急诊适应证及所有因急性呼吸道感染性疾病住院、住院期间新出现呼吸道感染症状(伴或不伴发热)、或出现不明原因的呼吸窘迫、慢性心肺疾病急性恶化、血液病、肿瘤患儿出现中性粒细胞减少/缺乏伴发热的,应根据年龄、临床特征和发病季节等,推荐选择核酸检测方法进行病原学诊断,为鉴别诊断需要可采用多重核酸检测。

(2)有急性呼吸道感染的危重症患儿,建议首选多重核酸检测。若常规核酸检测不能明确病原,推荐采用mNGS进行病原学检测,但其结果需要结合临床表现综合分析,必要时使用其他方法进一步验证。


呼吸道病原体核酸检测的标本类型及选择

适宜标本类型 

(1)上呼吸道标本主要有鼻拭子(nasal swab,NS)、口咽拭子(oropharyngeal swabs,OPS)、鼻咽拭子(nasopharyngeal swab,NPS)、鼻咽吸取物(nasopharyngeal aspirates,NPA)、鼻腔洗液(nasal washing,NW)和咽洗液等。SARS-CoV-2感染流行以来,上呼吸道各种标本的组合也得到了验证,使用OPS和前鼻孔取样的配对采集被证明与NPS采集的效能相当。唾液和咽喉漱口水等非侵入性方法易于采集,并可用于大规模人群监测,也被广泛关注。

(2)下呼吸道标本主要为痰、气管吸取物、支气管镜检查获得的标本,包括肺泡灌洗液(broncho alveolar lavage fluid,BALF)和保护性毛刷标本等。

(3)血液、胸腔积液、组织或局灶穿刺物等标本也可应用病原体核酸扩增检测(nucleic acid amplification test,NAAT)。

不同病原体检测的标本类型选择 

根据使用试剂盒的要求选择合适的呼吸道感染病原体检测的标本类型,对于非试剂盒指定适宜的标本类型,事先应对试剂盒进行适用性评估。

  • 病毒 

上、下呼吸道标本及血液、胸腔积液等标本均可用来行病毒NAAT。

  • 细菌 

(1)上呼吸道标本通常不推荐用于细菌NAAT。但百日咳鲍特菌主要感染鼻咽部,因此NPS适宜用于百日咳NAAT,有报道显示OPS与NPS检测百日咳的敏感性一致。

(2)诱导痰、气管吸取物和BALF等下呼吸道标本及无菌体液或组织标本是进行细菌NAAT的适宜标本。

  • 非典型病原体 

上、下呼吸道标本均适宜于肺炎支原体、肺炎衣原体和军团菌的NAAT,但下呼吸道标本的结果更具病原学诊断价值。

  • 真菌 

怀疑下呼吸道真菌感染时,建议采集BALF、无菌体液或组织标本进行真菌NAAT;怀疑真菌性鼻窦炎时可酌情采集鼻窦分泌物和组织标本。
各种标本采集及转运方法见表1,参照美国传染病学会和美国微生物学会2018年更新的“用于传染病诊断的微生物实验室使用指南”修订,供临床医师参考。

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引用本文:谢正德,邓继岿,任丽丽,等.儿童呼吸道感染病原体核酸检测专家共识[J].中华实用儿科临床杂志,2022,37(5):321-332. DOI: 10.3760/cma.j.cn101070-20211222-01490.


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